В 1637 году на правом берегу Иртыша, неподалеку от места впадения в Обь был образован Самаровский ям, которому, отводилась роль перевалочного пункта на пути сообщение между Западом и Востоком Западной Сибири.

Расположился он в живописном месте у подножия крутых, поросших густым кедрачом, гор.

Самаровский ям положил начало образованию села Самарово, где в 1940 году был образован Самаровский аэропорт Обского отдельного отряда ГВФ.

В1950 году в соответствии с Указом Президиума Верховного совета РСФСР районный центр Ханты-Мансийск преобразован в г. Ханты-Мансийск – центр Ханты-Мансийского автономного округа, с включением в черту города села Самарово.

В связи с этим событием в 1956 году аэропорт Самарово был переименован в аэропорт «Ханты-Мансийск».

Аэропорт тех лет представлял собой в зимнее время подготовленную площадку для взлета и посадки ВС на левом берегу Иртыша, а в летнее время гидросамолеты производили полеты прямо с акватории реки Иртыш.

В 1967 году в связи с разработкой открытых нефтяных и газовых месторождений Ханты-Мансийского автономного округа было принято решение о строительстве в городе Ханты-Мансийске, в нагорной его части, нового аэропорта.

Интенсивное развитие в округе нефтегазового комплекса, бурный рост объемов и повышение требований к авиаперевозкам требовало новых производственных мощностей аэропорта.

В начале 90-х годов администрацией Ханты-Мансийского автономного округа принимается решение о реконструкции аэропорта. Проект реконструкции предусматривал удлинение взлетно-посадочной полосы, расширение перрона, ремонт инженерных коммуникаций, склада ГСМ, строительство нового аэровокзала.

В феврале 1994г. в связи с реорганизацией Ханты-Мансийского объединенного авиаотряда, в составе которого находился аэропорт «Ханты-Мансийск», в городе создается общество с ограниченной ответственностью ''Юграавиа'', которое сегодня выполняет все необходимые функции по обеспечению работы и эксплуатации аэропорта «Ханты-Мансийск».

В 1997 г. принимается в эксплуатацию новая искусственная (асфальто-бетонная) взлетно-посадочная полоса длиной 2800м. и шириной 45 м., с высокой несущей способностью пригодная для приема практически всех типов воздушных судов.

С 2001 г. вводится в эксплуатацию новый аэровокзальный комплекс, оборудованный самой современной техникой.

АВК оригинального архитектурного решения гармонично вписался и украсил существующий комплекс сооружений аэропорта.

Пропускная способность АВК составляет до 300 пассажиров в час. Для удобства обслуживания пассажиров действуют два телескопических трапа, лифты, эскалаторы.

В 2003 году аэропорт «Ханты-Мансийск» по итогам конкурса 2002 года «Лучший аэропорт стран СНГ», организованного Ассоциацией «Аэропорт» ГА, членом которой он является, стал победителем в номинации «Интенсивно развивающийся аэропорт СНГ».

В 2004 году в аэропорту открыт постоянный воздушный грузопассажирский пункт пропуска через Государственную границу РФ с залом официальных лиц и делегаций. Пропускная способность международного сектора 100 человек в час и 150 тонн груза в сутки при круглосуточном режиме работы.

Открытие международного сектора в аэропорту на постоянной основе позволяет открыть рейсы в города ближнего зарубежья – на Украину, в Белоруссию, Среднюю Азию, организовывать чартерные рейсы на морские курорты Турции, Болгарии, ОАЭ и других туристических стран.

В настоящее время аэропорт связан регулярными рейсами со всеми городами округа, а так же Москвой, Санкт-Петербургом, Тюменью, Екатеринбургом, Новосибирском, Уфой и другими.

Развитая система дорог с твердым покрытием, регулярные рейсы по местным линиям в труднодоступные районы округа пассажирских вертолетов, а в летнее время водного транспорта, позволяет жителям и гостям округа в минимальные сроки прибывать в аэропорт к вылету.

Динамика роста пассажиропотока Ханты-Мансийского аэропорта за последние два года выглядит довольно оптимистично.

Прирост пассажиров воспользовавшихся услугами аэропорта в 2003 году составляет около 30 %.

Оживление воздушных перевозок в столице автономного округа связано с инвестиционной и деловой активностью в регионе.

В аэропорту располагаются представительства ОАО «Авиакомпания «ЮТэйр» и ЗАО «Авиакомпания «Хантыавиа».

В 2002 году аэропорт сертифицирован в ССГА по всем видам аэропортовой деятельности, получен Сертификат № 094 А-М Межгосударственного авиационного комитета (I категория ИКАО с МК пос2380 и выполнение международных полетов).

Сфера деятельности ООО ''Юграавиа''

полный комплекс наземного аэропортового и коммерческого обслуживания воздушных судов;

техническое обслуживание ВС;

обслуживание внутренних и международных перевозок: прием и отправка пассажиров, почты и грузов;

эксплуатация, обслуживание и ремонт объектов аэропорта и аэровокзала;

обеспечение эксплуатантов воздушных судов авиатопливом и горюче-смазочными материалами;

защита воздушных судов и наземных объектов от актов незаконного вмешательства;

аварийно-спасательное обеспечение полетов;

оказание различных услуг пассажирам, в том числе по гостиничному размещению и трансферту, общественному питанию;

услуги таможенного склада временного хранения.